2006-2007

• En febrero de 2006, Super Junior 05 comenzó las promociones de "Miracle", el segundo sencillo promocional del álbum debut. "Miracle" llegó a los primeros lugares de las listas musicales de Tailandia ,llamando la atención de los mercados internacionales. Cuando las promociones de "Miracle" terminaron, SM Entertainment comenzó a seleccionar los nuevos miembros para la segunda generación de Super Junior: Super Junior 06. La compañía incluso hizo una lista con los miembros que se iban a graduar del primer grupo. De cualquier forma, la compañía abandonó el concepto de rotación después de añadir el decimotercer miembro, Kyuhyun, el año 2006. El grupo pasó a ser simplemente Super Junior, sin el sufijo "05". Después de la adición de Kyuhyun Super Junior lanzó su sencillo "U" por descarga gratuita el 25 de mayo del 2006 en su sitio oficial. U excedió las 400,000 descargas en menos de 5 horas de lanzado y pasó posteriormente a 1.700.000 descargas, dañando el servidor. El sencillo físico U tenía un total de tres canciones y fue lanzado el 6 de junio. El sencillo se convirtió en una de las canciones más populares de Corea del Sur ese año, tomando el primer lugar en 5 ocasiones en los programas musicales. Para el fin de año, Super Junior recibió más de 7 premios en 5 ceremonias musicales de Corea del Sur. Uno de ellos fue "Mejor novato" en la 21va. entrega de los Golden Disk Awards. 

Afinales del 2006 Kyuhyun , Ryeowook y Yesung formaron Super junior-KRY siendo la primera sub-unidad de Super Junior. Ellos presentaron su primer secillo llamado "The One I Love" en el programa Music Bank de KBS el 5 de noviembre del 2006 y se convirtió en parte de la banda sonora del drama Hyena. En febrero del 2007, Leeteuk, Heechul, Kangin, Sunmin, Shindong y Eunhyuk formaron Super Junior-T , sub-unidad dedicada a la música Trot. Ellos lanzaron el primer sencillo "Rokuko" el 23 de febrero del 2007 e hicieron su debut en Popular song 2 dias despues.